2022年8月24-27日，2022年中国生物物理学会肠道菌群分会年会暨“崂山论肠菌”学术论坛在山东省青岛市圆满落幕。单细胞中心徐健研究员应邀主持肠道菌群数据挖掘与表征新技术分会场并做精彩报告。

菌群表征的核心问题之一是原位下菌群中哪个细胞具目标代谢功能？为什么？但是，元基因组、元转录组、元基因组-元代谢物组关联分析、同位素核酸探针标记耦合测序等“群落”层面解析手段，分辨率通常无法达到单细胞精度；而在“细胞个体”层面，针对菌群的单细胞荧光成像与分选，需要预知生物标识物并标记细胞，且信息量单一，故应用受限。因此，迫切需要发展新手段。

徐健研究员在报告中为与会专家学者分享了单细胞中心提出的（元）拉曼组概念：（元）拉曼组作为一种单细胞代谢表型组的表征手段，具免培养、活体分析、免标记、提供丰富代谢表型信息等优点，通过单细胞拉曼分选耦合测序或培养还能获得对应的单细胞基因组，或直接获取功能菌资源。其突破将开辟一条菌群单细胞多组学的新路线，加速菌群表征精度从群落深化到细胞个体这一重大变革。

基于拉曼组等单细胞代谢表型组学概念，中心成功研制 CAST-R、FlowRACS、RACS-Seq 、EasySort等一系列原创的微生物组单细胞分析科学仪器系列。其中，RACS-Seq可对各类细胞样品进行一站式单细胞代谢表型测量、单细胞拉曼分选、单细胞基因组解析和单细胞培养。基于稳定同位素标记底物饲喂单细胞拉曼光谱技术，RACS-Seq不需分离培养、在单细胞精度直接鉴定微生物种类，并测量各种代谢相关表型（及其细胞间异质性）。通过单细胞微液滴光镊拉曼分选与低偏好性核酸扩增技术，以获取高覆盖度、与代谢表型相关联的单细胞基因组。此外，还能在复杂菌群中直接耦合单细胞分离与单细胞微液滴培养。RACS-Seq为菌群的代谢活性快检、种质资源挖掘和功能机制研究提供了新一代、原创的装备解决方案。

大会期间，单细胞中心与中国海洋大学合作发明的微生物组测序技术2bRAD-M参与学术墙报展示，并摘得优秀墙报奖。

本次论坛由中国生物物理学会肠道菌群分会主办，中国微生物学会普通微生物学专业委员会和热心肠研究院协办，山东大学微生物技术国家重点实验室承办。

论坛设置“肠道菌群互作及功能基础研究”“肠道菌群与慢病的人群队列及临床研究”“肠道菌群与免疫”“肠道菌群数据挖掘与表征新技术”“肠道菌群干预与应用转化”“青年论坛”“期刊编辑与青年学者面对面”七个分会场，共有48位专家学者作了学术报告，设有34个学术墙报进行展示和交流，共同呈现了一场精彩的学术盛宴。